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双(叔丁基二甲基硅基)-反式-钙泊三醇由于分子中含有较大的有机基团和硅基，使其具有良好的脂溶性，在有机溶剂如氯仿、二氯甲烷、甲苯等中具有较好的溶解性，这一性质有利于其在有机合成反应中的操作和分离，也使其在生物体内更容易通过脂质膜等生物屏障，可能影响其在体内的吸收、分布和代谢过程。
双(叔丁基二甲基硅基)-反式-钙泊三醇具有特定的熔点和沸点，其熔点和沸点的数值与分子的结构和分子间作用力密切相关。相对较高的沸点和熔点使得在合成和纯化过程中，可以通过蒸馏、重结晶等方法进行分离和提纯，并且在常温下能够以固体形式稳定存在，便于储存和运输。