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双(叔丁基二甲基硅基)-反式-钙泊三醇主要的用途是作为关键中间体用于合成钙泊三醇，钙泊三醇是一种维生素 D3 衍生物，具有调节细胞分化和增殖等作用，它通过特定的化学反应步骤，经过去保护基等反应，可转化为具有生物活性的钙泊三醇，为大规模生产钙泊三醇提供了重要的合成前体。
除了用于合成钙泊三醇外，它还可作为重要的合成砌块用于制备其他维生素 D3 衍生物。通过对其结构进行修饰和改造，可以引入不同的官能团或进行结构优化，从而合成具有不同药理活性和作用机制的维生素 D3 衍生物，为新药研发提供了多样化的选择。